MongoDB採用Document Base的资料模型，每笔资料(对应到传统资料库的Row)被称为一个文档，以类似JSON的文档(Document)构建及储存。基于JSON的规格特性，MongoDB可以在栏位中储存其他文档，自然形成目录般的多层结构，称为次级结构；MongoDB内建多值支援，可以在栏位中储存多值阵列，无需另开表格。阵列栏位可被用户充份掌握，不但可以在上面建立索引也可以针对阵列中的个别元素进行搜寻与更新等操作，也可动态追加或删除其中的任意元素。

文档资料库对于开发人员而言既自然又灵活，因此开发人员能确保更高的生产力，并根据应用程式的需求更快地进行开发。作为一种NoSQL资料库，文档资料模型已成为关联式资料库的流行替代方案。